جامعه مسلمان ژاپن قدمتی صد ساله دارد. تعداد آنها تا قبل از دهه 1980 نسبتا کم بود. در حقیقت از سال 1867 که درهای ژاپن به روی مردمان دیگر جهان باز شد، مردم ژاپن توانستند با کشورهای دیگر بهویژه مسلمانان ارتباط برقرار کنند. سال 1877 کتابی درباره اسلام به زبان ژاپنی ترجمه شد و مردم تا حدی با اسلام آشنا شدند.